Protein–RNA interactions for Protein: Q969V3

NCLN, Nicalin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLNQ969V3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCLNQ969V3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCLNQ969V3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCLNQ969V3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms