Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NKD2Q969F2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKD2Q969F2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKD2Q969F2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms