Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP13Q92995 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP13Q92995 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP13Q92995 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP13Q92995 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP13Q92995 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP13Q92995 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP13Q92995 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP13Q92995 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP13Q92995 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP13Q92995 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
USP13Q92995 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP13Q92995 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP13Q92995 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP13Q92995 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP13Q92995 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP13Q92995 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP13Q92995 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP13Q92995 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP13Q92995 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP13Q92995 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP13Q92995 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP13Q92995 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP13Q92995 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP13Q92995 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP13Q92995 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP13Q92995 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP13Q92995 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP13Q92995 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP13Q92995 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP13Q92995 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP13Q92995 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP13Q92995 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP13Q92995 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP13Q92995 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP13Q92995 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP13Q92995 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP13Q92995 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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