Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NEO1Q92859 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NEO1Q92859 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NEO1Q92859 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NEO1Q92859 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NEO1Q92859 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms