Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXB13Q92826 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HOXB13Q92826 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HOXB13Q92826 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms