Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.39■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.36■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
CTTNBP2Q8WZ74 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
CTTNBP2Q8WZ74 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
CTTNBP2Q8WZ74 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
CTTNBP2Q8WZ74 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms