Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD1

RAB2B, Ras-related protein Rab-2B, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2BQ8WUD1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB2BQ8WUD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB2BQ8WUD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms