Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GRHL3Q8TE85 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GRHL3Q8TE85 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL3Q8TE85 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL3Q8TE85 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL3Q8TE85 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRHL3Q8TE85 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRHL3Q8TE85 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms