Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHD5Q8TDI0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHD5Q8TDI0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHD5Q8TDI0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms