Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APCDD1LQ8NCL9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
APCDD1LQ8NCL9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
APCDD1LQ8NCL9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms