Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SPC24Q8NBT2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPC24Q8NBT2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
SPC24Q8NBT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SPC24Q8NBT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms