Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHCHD4Q8N4Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHCHD4Q8N4Q1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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