Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PDCL2Q8N4E4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDCL2Q8N4E4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDCL2Q8N4E4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 704.8 ms