Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NLGN4XQ8N0W4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NLGN4XQ8N0W4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLGN4XQ8N0W4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms