Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MARCH9Q86YJ5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MARCH9Q86YJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARCH9Q86YJ5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms