Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PALB2Q86YC2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PALB2Q86YC2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PALB2Q86YC2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PALB2Q86YC2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms