Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNX32Q86XE0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX32Q86XE0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX32Q86XE0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms