Protein–RNA interactions for Protein: Q86W28

NLRP8, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP8Q86W28 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLRP8Q86W28 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NLRP8Q86W28 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRP8Q86W28 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRP8Q86W28 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms