Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPF39Q86UA1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF39Q86UA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRPF39Q86UA1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms