Protein–RNA interactions for Protein: Q86TU7

SETD3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD3Q86TU7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SETD3Q86TU7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SETD3Q86TU7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SETD3Q86TU7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SETD3Q86TU7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms