Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6W1

TMCO2, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO2Q7Z6W1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMCO2Q7Z6W1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMCO2Q7Z6W1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMCO2Q7Z6W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMCO2Q7Z6W1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms