Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP1BQ7LBR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHMP1BQ7LBR1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CHMP1BQ7LBR1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms