Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
HECW1Q76N89 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
HECW1Q76N89 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HECW1Q76N89 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
HECW1Q76N89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
HECW1Q76N89 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms