Protein–RNA interactions for Protein: Q717R9

CYS1, Cystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYS1Q717R9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CYS1Q717R9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CYS1Q717R9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CYS1Q717R9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms