Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFLNAQ6ZTI6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFLNAQ6ZTI6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFLNAQ6ZTI6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFLNAQ6ZTI6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFLNAQ6ZTI6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFLNAQ6ZTI6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFLNAQ6ZTI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFLNAQ6ZTI6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFLNAQ6ZTI6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms