Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRP0

PRR23C, Proline-rich protein 23C, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23CQ6ZRP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRR23CQ6ZRP0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRR23CQ6ZRP0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms