Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RBM44Q6ZP01 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RBM44Q6ZP01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RBM44Q6ZP01 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms