Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNG9

KRBA2, KRAB-A domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA2Q6ZNG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KRBA2Q6ZNG9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KRBA2Q6ZNG9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KRBA2Q6ZNG9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KRBA2Q6ZNG9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms