Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PDZRN4Q6ZMN7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PDZRN4Q6ZMN7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PDZRN4Q6ZMN7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms