Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
ZBED9Q6R2W3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
ZBED9Q6R2W3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBED9Q6R2W3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
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