Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ANKRD54Q6NXT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ANKRD54Q6NXT1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ANKRD54Q6NXT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ANKRD54Q6NXT1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms