Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRGCQ6NXR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRGCQ6NXR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRGCQ6NXR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms