Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
UFSP1Q6NVU6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
UFSP1Q6NVU6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms