Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ALKBH2Q6NS38 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ALKBH2Q6NS38 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALKBH2Q6NS38 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms