Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GDF6Q6KF10 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GDF6Q6KF10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GDF6Q6KF10 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms