Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCAPH2Q6IBW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCAPH2Q6IBW4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCAPH2Q6IBW4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms