Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RALGAPA1Q6GYQ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RALGAPA1Q6GYQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms