Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
CARMIL2Q6F5E8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CARMIL2Q6F5E8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CARMIL2Q6F5E8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
CARMIL2Q6F5E8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CARMIL2Q6F5E8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms