Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMK4

VASN, Vasorin, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASNQ6EMK4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VASNQ6EMK4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VASNQ6EMK4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms