Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC19Q6DKK2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC19Q6DKK2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms