Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CREB3L3Q68CJ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CREB3L3Q68CJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CREB3L3Q68CJ9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms