Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATG16L1Q676U5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATG16L1Q676U5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATG16L1Q676U5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms