Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C1orf53Q5VUE5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf53Q5VUE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C1orf53Q5VUE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C1orf53Q5VUE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms