Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
EEF1A1P5Q5VTE0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EEF1A1P5Q5VTE0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EEF1A1P5Q5VTE0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms