Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
STRIP1Q5VSL9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
STRIP1Q5VSL9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
STRIP1Q5VSL9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
STRIP1Q5VSL9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms