Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BEND3Q5T5X7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
BEND3Q5T5X7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BEND3Q5T5X7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BEND3Q5T5X7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms