Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SWT1Q5T5J6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SWT1Q5T5J6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SWT1Q5T5J6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms