Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4I8

C6orf52, Putative uncharacterized protein C6orf52, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf52Q5T4I8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
C6orf52Q5T4I8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C6orf52Q5T4I8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C6orf52Q5T4I8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms