Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SNAPC4Q5SXM2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SNAPC4Q5SXM2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SNAPC4Q5SXM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
SNAPC4Q5SXM2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
SNAPC4Q5SXM2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SNAPC4Q5SXM2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
SNAPC4Q5SXM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SNAPC4Q5SXM2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.32■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC39.32■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
SNAPC4Q5SXM2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
SNAPC4Q5SXM2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms