Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNT2

TMEM201, Transmembrane protein 201, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM201Q5SNT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM201Q5SNT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM201Q5SNT2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms